Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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