Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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E2F4Q16254 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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