Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ALX1Q15699 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ALX1Q15699 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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ALX1Q15699 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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