Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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TAF1AQ15573 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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TAF1AQ15573 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TAF1AQ15573 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TAF1AQ15573 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TAF1AQ15573 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TAF1AQ15573 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TAF1AQ15573 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TAF1AQ15573 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TAF1AQ15573 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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TAF1AQ15573 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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TAF1AQ15573 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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