Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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