Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms