Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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