Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EEA1Q15075 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EEA1Q15075 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EEA1Q15075 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EEA1Q15075 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
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