Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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