Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IKBKEQ14164 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IKBKEQ14164 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms