Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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