Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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ITGA9Q13797 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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ITGA9Q13797 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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ITGA9Q13797 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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ITGA9Q13797 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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ITGA9Q13797 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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ITGA9Q13797 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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ITGA9Q13797 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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ITGA9Q13797 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA9Q13797 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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