Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOFQ13790 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOFQ13790 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOFQ13790 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOFQ13790 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOFQ13790 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms