Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FHL3Q13643 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms