Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms