Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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MKRN4PQ13434 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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MKRN4PQ13434 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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MKRN4PQ13434 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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MKRN4PQ13434 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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MKRN4PQ13434 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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