Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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