Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD1Q13393 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms