Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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