Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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SP140Q13342 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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SP140Q13342 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SP140Q13342 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SP140Q13342 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SP140Q13342 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SP140Q13342 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP140Q13342 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP140Q13342 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP140Q13342 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP140Q13342 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP140Q13342 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP140Q13342 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP140Q13342 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP140Q13342 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP140Q13342 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP140Q13342 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP140Q13342 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP140Q13342 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP140Q13342 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP140Q13342 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP140Q13342 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP140Q13342 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP140Q13342 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP140Q13342 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP140Q13342 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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