Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCGB2A2Q13296 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms