Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RESTQ13127 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RESTQ13127 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RESTQ13127 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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