Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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