Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
PRDM2Q13029 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms