Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FOXI1Q12951 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FOXI1Q12951 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FOXI1Q12951 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FOXI1Q12951 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FOXI1Q12951 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FOXI1Q12951 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FOXI1Q12951 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FOXI1Q12951 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FOXI1Q12951 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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