Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF1Q12946 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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