Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.964e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.944e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.761e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 TMEM230-209ENST00000492419 1730 ntTSL 319.65■□□□□ 0.744e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 ATP5A1-207ENST00000588390 556 ntTSL 1 (best)19.4■□□□□ 0.74e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 ATP5A1-208ENST00000589252 662 ntTSL 519.4■□□□□ 0.74e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 ATP5A1-213ENST00000590406 756 ntTSL 319.4■□□□□ 0.74e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.674e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MZT2B-206ENST00000480182 480 ntTSL 1 (best)19.08■□□□□ 0.644e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.644e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.624e-6■■□□□ 12
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ILF3Q12906 TMEM230-208ENST00000379299 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)18.09■□□□□ 0.494e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.454e-6■■□□□ 12
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ILF3Q12906 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.424e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 STYXL1-211ENST00000474328 606 ntTSL 517.55■□□□□ 0.44e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.47e-8■■□□□ 12
ILF3Q12906 MZT2B-204ENST00000455239 401 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.38■□□□□ 0.374e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.344e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MZT2B-203ENST00000425361 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.88■□□□□ 0.294e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MZT2B-208ENST00000491178 234 ntTSL 316.15■□□□□ 0.184e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.174e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.151e-6■■□□□ 12
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ILF3Q12906 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.034e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 PNPLA3-202ENST00000406117 1480 ntTSL 214.99□□□□□ -0.014e-6■■□□□ 12
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ILF3Q12906 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.094e-6■■□□□ 12
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ILF3Q12906 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.284e-6■■□□□ 12
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ILF3Q12906 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.794e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 CCNB1IP1-208ENST00000553516 669 ntTSL 210.11□□□□□ -0.794e-6■■□□□ 12
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ILF3Q12906 CCNB1IP1-204ENST00000398163 1604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.874e-6■■□□□ 12
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ILF3Q12906 DNAJC7-218ENST00000590348 832 ntTSL 59.01□□□□□ -0.974e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MRPS28-207ENST00000521434 585 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.984e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 DNAJC7-223ENST00000591787 566 ntTSL 48.88□□□□□ -0.994e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 DNAJC7-215ENST00000589773 678 ntTSL 38.88□□□□□ -0.994e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 SMG1-216ENST00000569122 562 ntTSL 58.73□□□□□ -1.014e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 CCNB1IP1-202ENST00000358932 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.044e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 CCNB1IP1-201ENST00000353689 1305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.084e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.094e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 DNAJC7-212ENST00000589547 541 ntTSL 48.23□□□□□ -1.094e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 DNAJC7-214ENST00000589586 620 ntTSL 38.1□□□□□ -1.114e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.184e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 DNAJC7-221ENST00000590886 543 ntTSL 47.66□□□□□ -1.184e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.184e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 CCNB1IP1-214ENST00000556854 1294 ntTSL 57.63□□□□□ -1.194e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.214e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MRPS28-205ENST00000519386 555 ntTSL 26.91□□□□□ -1.34e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.324e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.334e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.334e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 SLMAP-214ENST00000467901 2698 ntTSL 26.69□□□□□ -1.344e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 CCNB1IP1-213ENST00000556563 646 ntTSL 36.48□□□□□ -1.374e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 DNAJC7-210ENST00000588641 782 ntTSL 36.41□□□□□ -1.384e-6■■□□□ 12
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