Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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NFIAQ12857 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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NFIAQ12857 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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NFIAQ12857 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NFIAQ12857 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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NFIAQ12857 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NFIAQ12857 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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