Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TROQ12816 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROQ12816 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROQ12816 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROQ12816 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROQ12816 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROQ12816 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROQ12816 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TROQ12816 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROQ12816 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROQ12816 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROQ12816 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROQ12816 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROQ12816 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROQ12816 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROQ12816 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROQ12816 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROQ12816 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROQ12816 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROQ12816 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROQ12816 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROQ12816 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROQ12816 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROQ12816 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TROQ12816 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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