Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms