Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM1Q08AH1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms