Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms