Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms