Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPCQ01831 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPCQ01831 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPCQ01831 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPCQ01831 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPCQ01831 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPCQ01831 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPCQ01831 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPCQ01831 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPCQ01831 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPCQ01831 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
XPCQ01831 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
XPCQ01831 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPCQ01831 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPCQ01831 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPCQ01831 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
XPCQ01831 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
XPCQ01831 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms