Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB1P82279 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB1P82279 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB1P82279 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRB1P82279 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRB1P82279 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms