Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UFM1P61960 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UFM1P61960 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms