Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCE1P61221 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms