Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms