Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSX2P58304 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSX2P58304 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms