Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP107P57740 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms