Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO3P55854 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO3P55854 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO3P55854 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO3P55854 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO3P55854 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO3P55854 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO3P55854 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO3P55854 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO3P55854 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO3P55854 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO3P55854 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO3P55854 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO3P55854 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms