Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA8P53708 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA8P53708 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms