Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms