Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSR4P51571 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SSR4P51571 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSR4P51571 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSR4P51571 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSR4P51571 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms