Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RORCP51449 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RORCP51449 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms