Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASCL1P50553 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASCL1P50553 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASCL1P50553 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ASCL1P50553 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASCL1P50553 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL1P50553 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL1P50553 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL1P50553 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL1P50553 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL1P50553 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL1P50553 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL1P50553 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms