Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI2P48788 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI2P48788 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI2P48788 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI2P48788 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI2P48788 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI2P48788 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI2P48788 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI2P48788 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI2P48788 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI2P48788 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms