Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A3P48764 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms