Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms