Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD8P48556 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms